东北农业大学设施农业科学与工程专业前身是成立于1948年的东北农学院果蔬专业，在1999年根据国家教育部专业调整方案，由蔬菜专业和果蔬专业合并成立园艺专业。从2006年开始，在对前期园艺专业教学工作进行全面总结的基础上，根据人才市场需求、社会需要和园艺产业发展趋势，对原有培养方案进行了多次修订，最终确定“专业统一招生，分方向培养”的策略，设置了“设施园艺”和“园艺种苗工程”两个专业方向。2012年，在“设施园艺”方向的基础上，申报设施农业科学与工程专业，并于同年9月开始招生。2022年获批国家级一流专业建设点。
设施农业科学与工程专业现有教师21人，其中，教授6名，研究员1名，副教授2名，高级实验师3名，中级职称9人。拥有国家农业现代产业技术体系岗位专家1人，二级教授1人，东北农业大学“学术骨干”获得者3人，“青年才俊”获得者8人。
本专业以设施园艺产业为核心，培养植根于龙江,面向于全国，德、智、体、美、劳全面发展，掌握园艺学、农业设施设计与建造、农业园区规划等方面的基本理论和基本知识，具有较强的设施农业操作和实践技能，能在农业及其他相关企事业部门从事现代农业设施工程设计、园艺作物生产及经营、农业园区管理、园产品研发、教学及科研等方面工作，具有创新精神和实践能力的农工结合复合性应用型人才。
